دستور matlab بسیار انعطاف پذیرتر است. در حقیقت کد matlab از قواعد AND و OR و 11 نوع تابع تعلق و دو نوع پارتیشن بندی grid و scattering پشتیبانی می کند. در حالیکه کد public-domain ANFIS تنها از قواعد AND، تابع تعلق generalized bell MF و پارتیشن بندی grid استفاده می کند.